生命科学学院应用生物研究所经学校批准于2006年10月17日正式成立了。根据我校“服务区域经济”的办学理念和宗旨，结合生命科学学院现有人才结构的特点，以及以植物学为龙头的专业建设发展规划，特成立应用生物研究所，该研究所目标主要定位于为皖西南地区农业发展服务。目前该研究所已开展的应用性研究工作有：1）日本红叶石楠等特色园林植物组织培养快速繁殖技术研究，目前已育苗近十万株，而且已与怀宁县财政局、生态农业园等单位达成共同推广的意向。2）利用生理生化及CO₂超临界技术提取桔梗皂甙和药用多糖的研究，目前该项目已与太和县经贸委达成合作开发意向。3）皖西南山区野生观赏植物的保护及开发应用，如多枝杜鹃等。近期计划开展的有：1）皖西南山区特有药用植物的开发应用，如霍山石槲等；2）利用现代生物学技术解决高效及特色农业发展中存在的问题，如解决铜陵白姜的疫病问题。